Princípios e aplicações da espectrometria de
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Princípios e aplicações da espectrometria de
Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 109 PRINCÍPIOS E APLICAÇÕES DA ESPECTROMETRIA DE MASSAS EM PRODUÇÃO ANIMAL Christina Ramires Ferreira1, Sérgio Adriano Saraiva1, Jerusa Simone Garcia1,2, Gustavo Braga Sanvido1, Felipe Perecin3, Rodrigo Ramos Catharino4, Rosineide Costa Simas1, Fábio César Gozzo5, Luiz Fernando Arruda Santos5, Helio Martins Junior6, Andréa Cristina Basso7, José Henrique Fortes Pontes7, Flávio Vieira Meirelles3, Mirela Batista Coelho1, Magali D’Angelo8 e Marcos Nogueira Eberlin1 1 Laboratório ThoMSon de Espectrometria de Massas, Instituto de Química, Unicamp, Campinas, SP, Brasil; 2Departamento de Ciências Exatas, Universidade Federal de Alfenas, Alfenas, MG, Brasil; 3Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, USP, Pirassununga, SP, Brasil; 4Departamento de Patologia Clínica, Faculdade de Ciências Médicas, Unicamp, Campinas, SP, Brasil; 5Laboratório Nacional de Luz Síncroton e Instituto de Química, Unicamp, Campinas, SP, Brasil; 6 Applied Biosystems do Brasil, São Paulo, SP, Brasil; 7Divisão de Pesquisas, In Vitro Brasil Ltda., Mogi-Mirim, SP, Brasil; 8Unidade de Biologia Celular do Centro de P&D de Sanidade Animal do Instituto Biológico, São Paulo, SP, Brasil. Endereço eletrônico: <[email protected]>. Introdução Como técnica analítica das mais versáteis e das mais sensíveis, a espectrometria de massas (MS) é atualmente uma das ferramentas analíticas valiosas em diversos estudos nas áreas de Biologia, de Ciências Médicas e de Ciências Tecnológicas. Por MS é possível determinar a massa molecular e quantificar biomoléculas, tais como proteínas, carboidratos, lipídeos e oligonucleotídeos, e também fragmentá-las de forma a elucidar sua estrutura e confirmar sua identificação. O potencial de aplicação da MS em estudos biológicos tem sido bastante estendido, em razão dos impressionantes avanços observados nos últimos anos nas áreas de genômica, de transcriptômica, de metabolômica, de proteômica, de lipidômica e de outras plataformas “omics”, e do desenvolvimento extraordinário dos equipamentos (HOFFMANN e STROOTBART, 2007; FENG et al., 2008). A MS é Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 110 atualmente a técnica de escolha para identificação de proteínas e para estudo de modificações proteicas pós-traducionais (MPTs) em diferentes condições fisiológicas. Além disso, a MS vem sendo utilizada no monitoramento e na caracterização de diversos processos industriais, tais como processos fermentativos (ROYCE, 1993) e até mesmo análise de microrganismos intactos (CLAYDON et al., 1996; FENSELAU e DEMIREV, 2001). Um exemplo dos recentes avanços em MS foi o desenvolvimento da técnica denominada MALDI1 imaging (IMS). Essa técnica utiliza a especificidade e a sensibilidade da MS para mapear e para produzir imagens de biomoléculas em cortes histológicos, permitindo o estudo da complexidade molecular em células (STOECKLI et al., 2001; CHAURAND et al., 2004). Por exemplo, recentemente a IMS foi utilizada para estudar a localização espacial, a estrutura molecular e a abundância relativa de diversas proteínas em diferentes períodos da gestação de embriões de camundongos. Foi possível identificar e mapear várias proteínas no mesmo corte histológico (ubiquitina, calciclina, calgizarina e outras) e não houve interferência do “ruído” de fundo, tornando a técnica vantajosa em relação à imunohistoquímica (BURNUM et al., 2008). Para análise por MS, as amostras podem ser inseridas diretamente no espectrômetro de massas, ou o equipamento pode ser acoplado a uma técnica de separação, como a cromatografia gasosa (GC), a cromatrografia líquida (LC) ou a eletroforese capilar. A possibilidade de automação aliada à rapidez das análises permite que grande número de amostras seja analisado em curto período de tempo (segundos ou minutos para cada amostra). Resumidamente, a análise por MS (Figura 1) consiste na geração de íons com base em compostos (orgânicos ou inorgânicos) por meio de um método de ionização apropriado. Em seguida, os íons são separados por meio de sua relação massa−carga (m/z) em um analisador de massas e detectados qualitativamente e ou quantitativamente por meio de um detector, o qual “conta” os íons. A magnitude do sinal elétrico em função da razão m/z é convertida por um processador de dados, o qual gera o espectro de massas correspondente (GROSS, 2004). Inicialmente a aplicação da MS estava restrita à análise de gases, de substâncias voláteis e de substâncias termicamente estáveis, pois as primeiras 1 MALDI = dessorção e ionização a laser assistida por matriz. Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 111 técnicas de ionização empregadas (ionização por elétrons e ionização química) são processos nos quais o analito é primeiramente vaporizado e a ionização só ocorre quando a molécula está na fase gasosa. Essa restrição impossibilitava a análise de biomoléculas, como proteínas, carboidratos e lipídeos, as quais não são voláteis e se degradam em alta temperatura de vaporização (KINTER e SCHERMAN, 2000). Figura 1. Diagrama de funcionamento de um espectrômetro de massas (APPLIED BIOSYSTEMS, 2005). Na década de 80, o desenvolvimento de técnicas de ionização mais brandas causou uma revolução na extensão das aplicações de MS. Essas técnicas foram principalmente as de ionização por electrospray – ESI (FENN et al., 1989, 1990) e de ionização e dessorção a laser assistida por matriz – MALDI (KARAS e HILLENKAMP, 1988). O termo “ionização branda” significa que os íons formados possuem baixa energia interna, o que permite a observação de espécies iônicas moleculares com pouca ou nenhuma fragmentação. As técnicas de ionização branda permitiram, portanto, a produção de íons com base em compostos de alta massa molecular e não-voláteis, estendendo a aplicação da MS a todos os tipos de moléculas. Graças ao desenvolvimento e à aplicação de ESI-MS e de MALDI-MS, os pesquisadores John B. Fenn e Koichi Tanaka receberam o prêmio Nobel em química em 2002. Existem outros tipos de técnicas que permitem a ionização de moléculas de média ou de baixa polaridade (como a fotoionização à pressão atmosférica e a Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 112 ionização química à pressão atmosférica). A técnica de ionização por elétrons é geralmente utilizada em GC-MS. Na ESI-MS e na MALDI-MS, os íons são obtidos por meio da protonação ou desprotonação de moléculas neutras, ou ainda pela adição de outros íons, como Na+, K+, NH4+ e Cl-, com formação de íons denominados adutos. As espécies observadas são, portanto, denominadas espécies protonadas [simbolizadas por (M + H)+], espécies desprotonadas [simbolizadas por (M – H)-] ou íons adutos [de sódio, simbolizados por (M + Na)+ ou de potássio (M + K)+, por exemplo] (CHAPMAN, 1993). A obtenção de espécies iônicas moleculares proporcionada por ESI e MALDIMS impulsionou o desenvolvimento de técnicas de fragmentação induzida visando à caracterização da estrutura molecular e à maior confiabilidade em experimentos de quantificação. Com isso, é aplicada a espectrometria de massas tandem ou sequencial (MS-MS), na qual fragmentos do íon de interesse são gerados por dissociação induzida por colisão (CID, do inglês collision-induced dissociation), ou seja, pela colisão de espécies iônicas moleculares com uma molécula de gás (tipicamente argônio) em uma câmara de colisão. A seguir, são exemplificadas algumas aplicações práticas e ainda potenciais de MS em aspectos de elevado interesse na área de produção animal, como em análises de produtos lácteos, em detecção e quantificação de substâncias de uso veterinário, em biotecnologia animal e em avaliação de alterações epigenéticas em animais clonados. É importante observar, porém, que as aplicações da MS na área de produção animal têm sido amplas e novas aplicações são relatadas em número e em extensão crescentes. Análises de produtos lácteos por espectrometria de massas A MS permite uma visão global e dinâmica dos constituintes de diversos alimentos e sua aplicação possui crescente interesse na indústria alimentícia. Devido à sua função primária, o leite é um alimento altamente complexo que desempenha papel fundamental na alimentação humana (FOX e McSWEENEY, 1998). A análise das proteínas do leite por MS é geralmente dificultada pela presença de algumas poucas proteínas muito abundantes que interferem na detecção de proteínas de menor abundância. Fong et al. (2008) estudaram o soro de leite bovino por métodos proteômicos, visando elucidar e melhor compreender a composição proteica do leite bovino e sua Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 113 relação com a bioatividade. Por meio de eletroforese bidimensional e de nanoreversed phase-liquid chromatography mass spectrometry (RP-LC-MS-MS), grande número de proteínas minoritárias de soro de leite foi identificado, algumas das quais não haviam sido relatadas anteriormente. O estudo da composição proteica dos glóbulos de gordura do leite (MFGMs) também foi alvo de diversos trabalhos de caracterização de componentes dessa secreção. Por exemplo, Reinhardt e Lippolis (2006) isolaram MFGMs de vacas holandesas que estavam no período médio de lactação, e realizaram fracionamento por eletroforese. Peptídeos provenientes da digestão tríptica de bandas dos géis analisados foram novamente fracionados em um cromatógrafo líquido de alta eficiência acoplado a um espectrômetro de massas. A análise dos dados resultou na identificação de 120 proteínas, das quais 71% foram caracterizadas como proteínas de membrana e o restante como proteínas citoplasmáticas ou secretadas. Apenas 15 proteínas identificadas nos MFGMs de bovinos haviam sido identificadas em estudos anteriores com MFGMs de ratos e de seres humanos. A MS também pode ser utilizada como ferramenta no controle de qualidade do leite e de seus derivados, bem como no controle de fraudes e de adulterações. Há relato de um método analítico rápido, simples e preciso por MALDI-time-of-flight (TOF) MS, destinado a avaliar tanto a presença de leite de vaca em amostras de leite cru de ovelha e de búfala utilizadas em processos industriais e a adição de leite em pó em amostras de leite cru. A presença de adulteração foi determinada pela avaliação dos perfis de proteínas, tais como α-lactoalbumina e β-lactoglobulina, utilizadas como marcadores moleculares. Sem pré-tratamento das amostras de leite e em razão da rapidez e da facilidade de utilização de MALDI-TOF MS, o protocolo analítico proposto pode ser utilizado como ferramenta de rotina para a identificação de possíveis adulterações de leite cru recebido diariamente pela indústria (COZZOLINO et al., 2001). Esses mesmos autores propuseram um método similar para a identificação da presença de leite de bovinos e de ovinos em queijo do tipo mozzarella (em português “mussarela de búfala”), por meio de utilização de MALDITOF MS. A diferenciação entre a mozzarella fabricada exclusivamente com leite de búfala e aquela que contenha misturas com leite bovino e, mais recentemente, leite ovino é realizada utilizando-se as proteínas do soro de leite, α-lactoalbumina e βlactoglobulinas como marcadores moleculares. Houve relação linear entre a resposta relativa de espécies iônicas moleculares e a abundância das proteínas de Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 114 soro de leite analisadas. Esses resultados abrem perspectivas de um novo campo para a MS na avaliação de possíveis fraudes na indústria de lacticínios. O uso da MS para estudo de bactérias lácticas, consideradas microrganismos benéficos para a saúde, também foi relatado (CHAMPOMIER-VERGÈS et al., 2002). Além da sua importância tecnológica, as bactérias lácticas têm importante impacto nas características organolépticas de produtos lácteos e estão relacionadas à produção de bacteriocinas. Estudos semelhantes também foram realizados com bactérias dos gêneros Enterococcus (GIARD et al., 2001) e Propionibacterium (LEVERRIER et al., 2004), conhecidas por desempenhar papel fundamental no queijo do tipo suíço. Streptococcus thermophilus é uma bactéria láctica termófila amplamente utilizada como fermento na fabricação de produtos lácteos, em especial na fabricação de iogurte, em combinação com Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus. No entanto, apesar da sua utilização maciça, o estado fisiológico de S. thermophilus no leite tem sido pouco investigado. Herve-Jimenez et al. (2008) estabeleceram, com aplicação da MALDI-TOF MS, o primeiro mapa proteômico citosólico (ou seja, das proteínas citoplasmáticas) de S. thermophilus LMG18311 cultivado no leite, com a identificação de 203 proteínas. Além disso, foi analisada a fisiologia desse estreptococo durante sua fase de crescimento tardia no leite (entre 2h e 30min e 5h e 30min de incubação). Observou-se a regulação dos peptídeos e dos aminoácidos (AA) transportadores, da biossíntese de AA específicos, em especial de AA com enxofre, e dos genes e das proteínas envolvidos no metabolismo de açúcares. Nos últimos anos, fortes evidências científicas têm sido fornecidas para a existência de atividades biológicas de peptídeos e de proteínas provenientes de alimentos que possam ter efeitos benéficos sobre a saúde humana. Foram comprovados benefícios para a saúde humana proporcionados por proteínas e por peptídeos bioativos obtidos de alimentos, principalmente quanto a ações imunomoduladoras, anti-hipertensivas, osteoprotetoras e antilipêmicas (MÖLLER et al., 2008). O conteúdo de dois peptídeos anti-hipertensivos − valina-prolina-prolina e isoleucina-prolina-prolina − em 101 amostras de dez variedades de queijo suíço foi avaliado com LC-MS. A menor média de concentração da soma dos dois tripetídeos foi encontrado no queijo do tipo L'Etivaz à rebibes (19,1 mg.kg-1), enquanto o queijo do tipo Appenzeller com 1/4 de gordura apresentou a maior concentração (182,2 mg.kg-1). Os resultados desse estudo mostram que diversas variedades tradicionais Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 115 de queijo contêm, em média, concentrações semelhantes dos dois peptídeos antihipertensivos quando comparadas aos produtos lácteos fermentados com ação reguladora sobre a pressão arterial recentemente desenvolvidos (BÜTIKOFER et al., 2008). Dessa maneira, as técnicas proteômicas têm se mostrado como ferramenta útil para a caracterização das proteínas de leite e de microrganismos lácticos. O próximo desafio envolve o estudo das proteínas, especialmente as enzimas, liberadas em matrizes complexas que são os produtos lácteos. Uma aplicação da MS ainda a ser desenvolvida seria a caracterização de patógenos causadores de mastite em amostras de leite fluido por MS fingerprinting. Com o diagnóstico rápido (alguns minutos, em vez de alguns dias para o cultivo microbiológico) da infecção nos animais afetados, seria possível estabelecer o tratamento antibiótico adequado e também proporcionar estratégias preventivas mais efetivas para o controle da mastite em rebanhos leiteiros. Espectrometria de massas em análises de resíduos de drogas utilizadas na produção animal A indústria farmacêutica mundial desenvolve continuamente novas substâncias para emprego em rebanhos comerciais visando à melhora da eficiência da produção animal. O uso dessas drogas faz com que o setor agropecuário e as agências reguladoras busquem tecnologias eficientes e sensíveis para detectar possíveis resíduos dessas substâncias, as quais não devem ser ingeridas pelo consumidor dos produtos de origem animal. Em análises de resíduos de drogas nesses produtos, a MS fornece resultados sensíveis e confiáveis. O grande desafio do monitoramento de resíduos de drogas em produtos animais é que os níveis considerados seguros para o consumo humano são extremamente baixos ou, em alguns casos, a tolerância a esses compostos e ou resíduos é praticamente nula. O cloranfenicol, por exemplo, um poderoso antibiótico bacteriostático de amplo espectro que foi amplamente administrado em animais, teve sua utilização proibida pela Comunidade Européia em 1994 (COMMISSION, 1994). Apesar da proibição ao uso, o cloranfenicol ainda é motivo de preocupação dos programas de monitoramento de resíduos em consequência de seu emprego irregular (Figura 2). Em concordância com a tolerância zero a resíduos de cloranfenicol em produção animal, a Comissão de Decisão 2003/181/EC da Comunidade Européia estabeleceu o limite mínimo de 0,30 µg.kg-1 ao desempenho Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 116 requerido para a análise de substâncias proibidas ou não autorizadas, além de definir o número mínimo de pontos de identificação para a confirmação dos resultados (COMMISSION, 2002). A técnica de referência recomendada na maioria dos casos é a LC-MS-MS, por ser rápida, sensível e seletiva. Além disso, é uma técnica autoconfirmatória, que evita a emissão de laudos com resultados falsospositivos ou falsos-negativos. Figura 2. Cromatograma e espectros de massas ESI-MS e ESI-MS/MS de amostra de leite bovino com 0,050 µg.L-1 de cloranfenicol. Fonte: Martins-Júnior et al. (2006). Existe grande diversidade de substâncias ou de drogas utilizadas que visam melhorar a produção animal, tais como antibióticos, hormônios e antiparasitários. Nesse contexto, a MS, nas suas mais diversas modalidades, é uma técnica analítica que apresenta rapidez e sensibilidade adequadas. Por exemplo, rotineiramente equipamentos de LC-MS-MS permitem a detecção e a quantificação de centenas de drogas em uma única análise. O Codex Alimentarius (2009), da Organização para a Agricultura e a Alimentação e da Organização Mundial da Saúde, define resíduo de uma droga veterinária como a fração da droga, seus metabólitos, produtos de conversão ou reação e impurezas que permanecem no alimento originário de animais tratados. É importante frisar que nem todas as drogas e nem todos os compostos químicos a que os animais ficam expostos deixam resíduos perigosos à saúde humana e à saúde animal. Por isso, existe o limite de tolerância ou o limite máximo de resíduo (LMR) que o alimento pode conter, sem prejuízo para a integridade orgânica de seres humanos e de animais. Após a conclusão desses estudos, organizações Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil internacionais envolvidas na saúde pública analisam os resultados 117 e, posteriormente, recomendam os LMR's dos compostos aprovados à consideração dos países membros do Codex Alimentarius. O Plano Nacional de Controle de Resíduos Biológicos em Produtos de Origem Animal (PNCRB), foi instituído pela Portaria Ministerial no 51 de 6 de maio de 1986. O plano prevê a adoção de programas setoriais para controle de resíduos e de contaminantes em carnes (de bovinos, de aves, de suínos e de equinos), em leite, em mel e em pescado (BRASIL, 2006). Esse plano foi revisado pela Instrução Normativa no 9 de 30 de março de 2007 e, embora esteja em vigor somente para o controle para carnes (PNCRC), existem várias tabelas que regulamentam o controle de antimicrobianos, de anabolizantes, de micotoxinas, de sulfonamidas, de metabólitos de nitrofuranos e de avermectinas, entre outros, em leite, em mel, em ovos, em pescado e em seus derivados, cujos níveis vão de miligramas a nanogramas por quilograma ou devem até ser nulos se a droga for banida (Figura 3). Figura 3. A (esquerda): Cromatograma obtido de análise por cromatrografia líquida com espectrometria de massas em tandem (LC-MS/MS) de sulfonamidas em leite na concentração de 0,2 µg.L-1. B (direita): Cromatograma de detecção de avermectinas em carne por LC-MS/MS na concentração de 5,0 µg.kg-1. De acordo com informações disponíveis na literatura, as substâncias e as drogas controladas podem ser classificadas em dois grandes grupos. O grupo A engloba substâncias e drogas não autorizadas e com efeito anabólico, tais como Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 118 esteróides, β-agonistas e lactonas. Já o grupo B inclui substâncias permitidas para uso em produção animal, mas com quantidade de resíduos limitada ou proibida, tais como antibacterianos, drogas de efeito sedativo, anti-inflamatórios, anti-helmínticos e anticoccidianos (De BRABANDER et al., 2007; REIG e TOLDRÁ, 2008). A técnica de LC-MS-MS foi utilizada por Martins-Júnior et al. (2007) para a detecção e a confirmação de múltiplas classes de medicamentos, tais como βlactâmicos, tetraciclinas, sulfonamidas, cefalosporinas e macrolídeos em leite bovino. Nesse trabalho, nove marcas de leite foram adquiridas em mercados da Capital de São Paulo e a presença dessas drogas foi verificada em limites de quantificação que variavam entre 0,75 e 7,5 µg.L-1 desses compostos, exceto na eritromicina, validada na concentração de 37,5 µg.L-1. De Brabander et al. (2007) fizeram ampla revisão da evolução das técnicas para análise de resíduos de substâncias não permitidas pela legislação da Comunidade Econômica Européia na produção de carne, desde o uso da cromatografia em camada delgada no início dos anos de 1970 até o uso de técnicas cromatográficas mais atuais, como o acoplamento de ultra performance liquid chromatography (UPLC) à MS. Zeleny et al. (2009) relataram o uso do LC-MS com fonte de ionização por electrospray para a detecção e a quantificação simultânea de compostos de nitroimidazol (droga utilizada contra protozoários e para combater infecções bacterianas) presentes em carne de porco. Com a metodologia desenvolvida, foi possível identificar e quantificar seis espécies de interesse (dentre eles, três metabólitos) em níveis inferiores a microgramas por quilograma. Outro trabalho de identificação e de quantificação de drogas usadas no combate a infecções ocasionadas por bactérias e coccídeos, utilizando LC-MS, foi feito por Li et al. (2009). Esses autores desenvolveram e validaram uma metodologia para analisar sulfadimetoxina e seu metabólito (N-acetilsulfadimetoxina) em amostras de plasma, de urina e de fluido oral, além de tecido do rim e do fígado de bovinos. Os limites de quantificação para ambos os analitos nessas amostras foram de 2, 100 e 5 mg.L-1 no plasma, na urina e no fluido oral, respectivamente. Já nas amostras de rim e de fígado, os limites de quantificação foram de 10 µg.kg-1. Nos EUA, a concentração tolerável do metabólito dessa droga nos tecidos comestíveis do gado é de 0,1 mg.kg1 . Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 119 A técnica de LC-MS foi utilizada também na determinação da azaperona e seu metabolito azeperol em vários tecidos animais (músculo, tecido adiposo e fígado), além de leite (AOKI et al., 2009). Essa droga apresenta efeitos sedativos e antieméticos, e é utilizada como tranqüilizante em suínos e equinos. Em suínos a azaperona é usada para evitar estresse durante o transporte dos animais da fazenda ao abatedouro, o que pode causar aumento na mortalidade ou piora na qualidade da carne. A aplicabilidade da UPLC acoplado à MS com analisadores de tempo de vôo (UPLC-TOFMS) e de orbitrap (UPLC-orbitrap MS) foi demonstrada na análise de hormônios e de resíduos de outras drogas presentes em pelos bovinos e em ração animal (VAN DER HEEF et al., 2009). Os autores realizaram vários testes em que a resolução empregada nesses equipamentos foi avaliada. Foi possível determinar com exatidão (<5 mg.kg-1), e portanto com alta confiabilidade, as massas de vários compostos e quantificá-los em níveis de microgramas por quilograma. No caso do emprego da UPLC-orbitrap MS foi possível monitorar simultaneamente a presença de 14 esteróides nos pelos, apesar da complexidade da matriz da amostra. As drogas descritas nas tabelas do PNCRB têm LMRs extremamente baixos ou são banidas para uso veterinário. Para determinar os resíduos dessas drogas ou seus metabólitos é necessário utilizar tecidos musculares, vísceras, gordura, urina, plasma, leite ou ovos inteiros ou em partes (clara ou gema). As matrizes das amostras desse material são complexas e por meio de técnicas analíticas clássicas não é possível a quantificação na sensibilidade requerida. Por isso, a utilização de espectrômetros de massas triploquadrupolos com fonte de ionização por electrospray ou de ionização química à pressão atmosférica se tornaram a alternativa mais viável para atender à legislação brasileira e garantir a qualidade dos produtos agropecuários exportados para os mercados externos que possuem legislações até mais rigorosas do que a do nosso País. Contribuição da espectrometria de massas em Biotecnologia da Reprodução Atualmente, as pesquisas que visam a novas aplicações de MS na área de biotecnologia de embriões podem ser divididas em quatro grupos principais: (i) controle de qualidade de meios utilizados para a produção in vitro (PIV) de embriões, (ii) lipidoma de oócitos e de embriões, (iii) estudos de composição de soro fetal Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 120 bovino e (iv) detecção de patógenos em meios utilizados para PIV de embriões bovinos. Controle de qualidade de meios utilizados para a produção in vitro de embriões A MS pode ser utilizada para obter o perfil químico (ou fingerprint) de meios utilizados para a PIV de embriões visando ao controle de sua qualidade. Foram obtidos perfis químicos com mínimo preparo de amostra (somente diluição dos meios de cultivo em água) e infusão direta por nano-electrospray em modo positivo [nano-ESI(+)-MS]. Os quatro meios estudados [maturação in vitro – MIV, fertilização in vitro – FIV, synthetic oviduct fluid – SOF e ácido 4-(2-hidroxietil)-1-piperazina etanossulfônico (Hepes) SOF – HSOF] foram diferenciados pelo seu perfil químico (Figura 4), utilizando análise de componentes principais. Figura 4. Espectrometria de massas com fonte de Nano-electrospray (Nano-ESIMS). Fingerprintings de quatro meios utilizados para a produção in vitro de embriões bovinos (IVM: meio de maturação in vitro; IVF: meio de fertilização in vitro; SOF: Synthetic Oviduct Fluid; HSOF: Synthetic Oviduct Fluid tamponado com HEPES. Fonte: adaptado de Ferreira et al. (2009b). Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 121 A PIV de embriões bovinos com a utilização de meios estocados a +4oC por até 45 dias não apresentou variação na clivagem e no desenvolvimento até a fase de blastocisto (P < 0,05) nem alteração do perfil químico por nano-ESI(+)-MS. Quando os meios foram expostos a choque de calor (60oC por três horas), não houve diminuição do desenvolvimento embrionário (P > 0,05), mas o perfil químico de todos os meios foi significativamente afetado. Quando os meios foram congelados (–70oC por dois meses), novamente não foi observado diminuição significativa do desenvolvimento embrionário, porém o perfil químico dos meios foi afetado. Dessa maneira, embora a seletividade tenha sido suficiente sem procedimento de extração, protocolos mais complexos de preparo de amostra podem ser avaliados para aumentar a especificidade em relação a determinados componentes (p. ex., peptídeos e lipídeos). A aplicação dessa tecnologia deve ser otimizada para cada laboratório, dependendo do meio de cultivo específico e das condições de armazenamento, mediante a construção de um banco de dados específico de fingerprints. Novas pesquisas serão realizadas visando à avaliação do uso de nano-ESI(+)-MS para monitorar o metabolismo embrionário in vitro e para determinar os efeitos isolados dos meios de MIV, de FIV, de SOF e de HSOF (FERREIRA et al., 2009b). Lipidoma de oócitos e de embriões No último relatório da Sociedade Internacional de Transferência de Embriões (THIBIER, 2006), o Brasil foi classificado como o primeiro país em volume de produção de embriões in vitro. Essa atividade tornou-se intensa no País em razão da combinação de vários fatores, tais como o volume do rebanho, a preponderância de raças zebuínas e as condições do mercado no Brasil (PONTES et al., 2008). A qualidade e a sobrevivência dos embriões produzidos in vitro são, entretanto, inferiores às dos embriões gerados in vivo (BONI et al., 1999). Estudos com gametas e embriões de mamíferos indicaram que a composição de ácidos graxos influencia a maturação oocitária, a fertilidade e o desenvolvimento embrionário in vitro (KHANDOKER e TSUJII, 1999). Nos estudos sobre a composição de ácidos graxos em oócitos e em embriões de mamíferos utiliza-se frequentemente a técnica de GC com necessidade de transesterificação e de metilação da amostra (KHANDOKER et al., 1997, 1998; KHANDOKER e TSUJII, 1999; McEVOY et al., 2000; KIM et al., 2001,). Entretanto, a técnica de MS tem sido Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 122 utilizada com sucesso em estudos de lipidoma. Na análise de fosfolipídeos em membranas celulares, até mesmo de células-tronco, recentemente descrita, utilizouse a técnica de MALDI-TOF MS em vários modelos biológicos (SCHILLER et al., 2004, 2007; FUCHS e SCHILLER, 2008; FUCHS et al., 2008b,c). Além disso, o perfil químico ou o fingerprint de fosfolipídeos foi utilizado para diferenciar espermatozóides de felídeos e de ruminantes (FUCHS et al., 2008a). Foram obtidos espectros individuais de oócitos e de embriões bovinos por MALDI-TOF (FERREIRA et al., 2008; Figura 5). Os triacilglicerídeos (TAG) não foram detectados nos oócitos imaturos, ocorreram em pequena quantidade nos oócitos maturados e apareceram claramente nos embriões. TAG são detectados como adutos de sódio [M + Na]+ . (“M” significa massa molecular). Figura 5. Espectros de massas que indicam TAG de um oócito imaturo, de um oócito maturado e de um blastocisto. Os espectros foram obtidos por espectrometria de massas por dessorção e ionização a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS) com matriz ácido 2,5,-dihidroxido benzóido (DHB). Nos oócitos maduros e nos embriões foram observados TAG com m/z de 827 (C51H96O6 ; 50:5), de 851 (C53H96O6; 50:3), de 853 (C51H98O6; 50:2) e de 881 (C55H102O6; 52:2). Além desses, somente os embriões apresentaram ainda TAG de Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 123 m/z de 883 (C55H104O6; 52:1), de 907 (C57H104O6; 54:3) e de 909 (C57H106O6; 54:2). Os TAG descritos possuem em sua composição os ácidos palmitoleico (16:1), palmítico (16:0), linolênico (18:3), linoleico (18:2), oleico (18:1) e esteárico (18:0). Também foi possível detectar fosfolipídeos, principalmente fosfocolinas, em oócitos individuais de seres humanos, de bovinos, de ovinos e de peixes. Cada espécie apresentou um perfil característico. Esse perfil variou também entre oócitos e entre embriões bovinos (FERREIRA et al., 2009a). Estudo da composição do soro fetal bovino por espectrometria de massas O soro fetal bovino (SFB) é um suplemento comumente utilizado para a PIV. Além de riscos sanitários, sabe-se que o SFB influencia a velocidade do desenvolvimento, a expressão gênica e a composição lipídica de embriões (RIZOS et al. 2003; WRENZYCKI et al., 2005). A utilização da MS para caracterização da composição do SFB pode trazer informações importantes sobre o desenvolvimento de um substituto sintético de SFB, de composição definida e adequada para o uso na PIV comercial e acadêmica de embriões de ruminantes. Estudos iniciais proporcionaram dados sobre a composição lipídica do SFB por MALDI-TOF MS (GARCIA et al., 2009) e sobre a quantificação de estradiol por LC-MS-MS com limite de detecção de 0,08 pg.mL-1 e limite de quantificação de 0,25 pg.mL-1 em diferentes partidas de soro fetal bovino, assim como em soro ovino e em soro caprino (MARTINS-JÚNIOR et al., 2009). Estudos futuros serão conduzidos para a quantificação de aminoácidos e de vitaminas. Detecção de patógenos em meios utilizados para PIV de embriões bovinos por espectrometria Do ponto de vista econômico, o desempenho reprodutivo é crucial para a produtividade na pecuária (NEVES et al., 1999). Em bovinos, em razão do interesse crescente em se obter maior exploração do potencial genético de fêmeas para incremento da produção animal, a PIV comercial de embriões tem sido desenvolvida e aprimorada (RENESTO, 2004). Com o aumento da comercialização, intensifica-se a preocupação pelo aspecto sanitário de embriões. Vários métodos de prevenção são utilizados para se obter embriões livres de patógenos específicos. As biotécnicas representam um desafio para o controle da transmissão de doenças, pois produzem novos ambientes, promovem manipulação excessiva do material e Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 124 aumentam a oportunidade de contaminação e de disseminação de patógenos (STRINGFELLOW et al., 2004). A técnica de MALDI-MS tem sido muito utilizada para a caracterização de microrganismos em razão da sua capacidade de analisar moléculas de massa elevada e misturas complexas de biomoléculas, e ainda por apresentar alta sensibilidade mesmo em reduzida quantidade de amostra (SIUZDAK, 2006). Por esse método, bactérias podem ser identificadas mediante comparação de seu espectro de massa (obtido em poucos segundos) com espectros de referência de cepas, por meio de análise estatística multivariada. A discriminação e a caracterização de micobactérias foi obtida por MALDI-TOF MS (HETTICK et al., 2006). A técnica foi usada também em estudos de quimiotaxonomia bacteriana (CLAYDON et al., 1996; SMOLE et al., 2002; RUELLE et al., 2004). Recentemente, nove cepas de bactérias anaeróbias foram caracterizadas por MALDI-TOF; aplicouse o método para identificação com sucesso dessas bactérias em amostras de 75 pacientes que apresentaram infecção periodontal. Os autores sugeriram que a técnica de MALDI-TOF MS poderá se tornar útil para a identificação de bactérias anaeróbicas, especialmente aquelas que não podem ser prontamente identificadas por análise bioquímica. Dessa forma, essa técnica poderá ser atrativa até mesmo na identificação de rotina de amostras clínicas (STINGU et al., 2008). Um próximo desafio é desenvolver a aplicação da técnica de MS para o diagnóstico e o monitoramento, de maneira não-invasiva e rápida, da sanidade de embriões bovinos produzidos in vitro, visando ao diagnóstico e ao monitoramento desses patógenos. Perspectivas do uso da espectrometria de massas em estudos epigenéticos aplicados à transferência nuclear Os avanços no campo da biologia celular revelaram que as células possuem, além das informações contidas na molécula de DNA, outro conjunto de informações conhecido como epigenética. Os mecanismos epigenéticos são responsáveis por diversos fenômenos, tais como a diferenciação celular, o envelhecimento, o câncer e o desenvolvimento embrionário. No entanto, essas marcações epigenéticas são múltiplas e as diferentes combinações entre elas produzem diferentes resultados. Técnicas baseadas na MS têm o potencial de mapear essas distintas combinações e Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 125 de estudá-las dentro de um contexto, tornando claras suas interrelações e seu significado biológico. Conceito de epigenética O controle da expressão gênica nas células eucariotas ocorre pela ligação de fatores de transcrição nas regiões promotoras dos genes ou pela interação entre proteínas ou entre regiões promotoras e sequências regulatórias dentro do próprio DNA, capazes de influenciar a taxa de transcrição. A expressão gênica é controlada também por modificações covalentes na própria fita de DNA ou pelo empacotamento do DNA sob a forma de cromatina. Esses mecanismos são coletivamente denominados “epigenéticos”. Epigenética significa, literalmente, “sobre os genes” e refere-se às modificações nos genes que não incluam alterações na sequência de DNA propriamente dita. Há dois tipos principais de alterações epigenéticas: a metilação do DNA e as modificações pós-traducionais (MPTs) nas histonas, principais proteínas que compõem a cromatina. A metilação do DNA ocorre na posição 5 do anel pirimídico que forma a molécula de citosina, transformando-a em 5-metilcitosina. As modificações póstraducionais nas histonas, por sua vez, ocorrem nas caudas dos resíduos de aminoácidos que se projetam do nucleossomo. Essas modificações incluem acetilação, metilação, fosforilação, ubiquitinação, ribosilação e sumoilação. As diferentes combinações entre as modificações covalentes das histonas formam um código, conhecido como “código das histonas”. As modificações nas citosinas e as modificações pós-traducionais das histonas determinam a estrutura, o padrão de condensação e, principalmente, a atividade transcricional da cromatina. Embora todas as células dos organismos multicelulares contenham a mesma sequência de DNA e a mesma informação genética, há um conjunto de informações epigenéticas distinto entre elas, o qual permite que os genes adequados sejam expressos nos tecidos ou nos tipos celulares, produzindo um controle harmônico de quais genes serão expressos em quais tecidos e a que tempo. O código epigenético pode ser entendido como um segundo grupo de informações, que está associado ao código genético. Portanto, os organismos multicelulares possuem um único genoma ao qual estão associados múltiplos epigenomas. Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 126 A espectrometria de massas como ferramenta para o estudo do epigenoma A regulação epigenética por meio das modificações na cromatina possui grande importância biológica e participa de processos tais como o estabelecimento e a manutenção da pluripotência em células-tronco, a diferenciação celular e o controle da divisão celular e o câncer. No campo das biotécnicas da reprodução, os eventos epigenéticos tornam-se importantes pelo papel crítico que desempenham no desenvolvimento embrionário inicial. Nessa fase, a cromatina passa por uma série de alterações genericamente denominadas de reprogramação epigenética. Essas alterações estabelecem os padrões de expressão compatíveis com o início do desenvolvimento celular. Na técnica de clonagem por transferência nuclear, o entendimento dos eventos epigenéticos ganha importância adicional. A transferência nuclear de células somáticas consiste na introdução de um núcleo de uma célula somática doadora em um oócito enucleado para gerar um animal clonado. A produção de animais vivos após a transferência nuclear demonstrou que o estado epigenético das células somáticas, incluindo aquelas terminalmente diferenciadas, apesar de estável, não é irreversível e pode ser reprogramado para um estado embrionário capaz de comandar o desenvolvimento de um novo organismo (JAENISCH e YOUNG, 2008). Entretanto, embriões bovinos produzidos por transferência nuclear apresentam baixo potencial de desenvolvimento gestacional e apenas pequena quantia dos embriões clonados resulta em nascimento. Grande parcela dessa ineficiência da técnica é decorrente de inapropriada reprogramação epigenética do núcleo transferido (RIDEOUT III et al., 2001). A reprogramação epigenética do núcleo da célula somática envolve desmetilação do DNA e alterações nas histonas associadas (SIMONSSON e GURDON, 2004). Embora o núcleo da célula doadora seja parcialmente desmetilado após transferência para um oócito enucleado, a desmetilação posterior não ocorre de maneira completa, enquanto o estabelecimento dos novos padrões de metilação se dá precocemente em grande proporção dos embriões clonados (REIK et al., 2001). De maneira semelhante, alterações nos padrões de modificações pós-traducionais das histonas já foram descritas em embriões e em animais clonados e estão associadas à baixa viabilidade desses clones (SANTOS et al., 2003). Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 127 Os métodos mais utilizados para identificação da metilação do DNA são baseados no tratamento do DNA com bissulfito de sódio. Nesse tratamento, as citosinas não metiladas são convertidas em uracilas. A detecção pode ser feita com sequenciamento de DNA, por reação em cadeia da polimerase sensível à metilação ou por digestão com enzimas de restrição sensíveis à metilação. Embora esses métodos sejam capazes de gerar resultados de alta resolução, com a detecção específica e ou pontual de citosinas metiladas, eles exigem intenso trabalho laboratorial, especialmente quando se deseja mensurar os níveis de metilação. A associação das técnicas de conversão com bissulfito de sódio e de MALDI-TOF permite a execução de ensaios que quantificam as metilações do DNA com precisão (SONG et al., 2009). Com essa estratégia, é possível determinar, por exemplo, se determinado tratamento provocou aumento ou diminuição na quantidade de metilação do DNA em uma sequência de DNA específica. As estratégias de estudo do epigenoma com MS revelam-se ainda mais interessantes quando utilizadas para mapear as modificações pós-traducionais (MPTs) das histonas. O estudo do código das histonas pode ser feito por meio de imunocitoquímica, uma abordagem que permite o estudo apenas de modificações covalentes particulares das histonas, para as quais se utilizam anticorpos específicos. Essa abordagem exige conhecimento prévio das MPTs que se deseja verificar e limita o número de ensaios concomitantes. Resumidamente, a análise de MPTs envolve a digestão de proteínas em pequenos peptídeos com uma enzima (tripsina), a separação desses peptídeos por técnicas cromatográficas e a ionização no espectrômetro de massas por ESI para obtenção de informações sequenciais por MS-MS. A tripsina cliva o C-terminal nos resíduos de arginina e de lisina, produzindo uma mistura complexa de peptídeos com um resíduo de aminoácido básico por peptídeo. Esses peptídeos ionizam por electrospray para um estado de baixa carga, no qual geralmente são dissociados. Embora a MS-MS por CID seja uma técnica mais poderosa, ela apresenta algumas limitações na investigação de MPTs com a finalidade de entender suas funções biológicas. Em razão das variadas ligações durante a transcrição e as MPTs, as proteínas frequentemente apresentam múltiplas formas com diferentes funções ou atividades biológicas. A atividade biológica e a função de qualquer proteína são determinadas pela sua sequência e pela sua estrutura, incluindo agregados de suas MPTs. O efeito funcional de uma MPT, em particular em um Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 128 aminoácido específico, pode depender do tipo e da presença ou da ausência de outras MPTs em outros sítios relativamente remotos na proteína (MIKESH et al., 2006). Abordagens que utilizam a espectrometria de massas, especificamente aquelas baseadas na fragmentação e no sequenciamento dos aminoácidos, tais como a espectrometria de massas por dissociação por captura de elétrons (ECDMS) e a espectrometria de massas por dissociação por transferência de elétrons (ETD-MS), são capazes de mapear múltiplas modificações pós-traducionais presentes na mesma proteína. Isso permite o estudo de interações e de combinações entre as diferentes MPTs, sem a necessidade de conhecimento prévio de quais modificações estão presentes (PHANSTIEL et al., 2008; PLAZASMAYORCA et al., 2009) A dissociação de peptídeos por ECD foi introduzida por McLafferty et al. há dez anos. Nessa técnica, elétrons de baixa energia reagem com peptídeos catiônicos armazenados em equipamentos do tipo ion trap, os quais podem estar incluídos em espectrômetros de massas por ressonância ciclotônica de íons e transformada de Fourrier (ICR-FT MS). Diferentemente de CID, a ECD não cliva modificações químicas nas cadeias laterais do peptídeo, mas induz preferencialmente quebras randômicas do peptídeo em suas ligações peptídicas. Com ECD, as modificações lábeis, tais como a fosforilação (STENSBALLE et al., 2000; SHI et al., 2001), a N-glicosilação e a O-glicosilação (MIRGORODSKAYA et al., 1999) e a sulfonação (KELLEHER et al., 1999), assim como outras MPTs lábeis, permanecem essencialmente intactas. A ETD é um novo método, similar à ECD, para fragmentar peptídeos, a qual utiliza a técnica química de reações do tipo íon a íon. Os fragmentos são gerados por ETD pela transferência de um elétron de um radical aniônico para o peptídeo protonado. Essa transferência libera energia que induz a fragmentação do esqueleto peptídico, causando clivagem das ligações Cα-N, como na ECD. A fragmentação por ETD cria complementaridade ao formar os íons dos tipos c- e z- em vez dos íons típicos dos tipos b- e y- observados por CID. Embora os mecanismos de ECD e de ETD ainda estejam sendo debatidos, a ETD preserva as MPTs que são lábeis pela CID, de tal forma que a sequência com informações dos sítios de MPT nos peptídeos possa ser obtida. ETDs podem ser realizadas por equipamentos do tipo Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 129 ion traps quadrupolares, em vez equipamentos ICR-FT MS, os quais são mais caros e possuem custo alto de manutenção (SYKA et al., 2004). O estudo do epigenoma avançou rapidamente nos últimos anos, revelando a importância das modificações epigenéticas na diferenciação celular e no desenvolvimento embrionário inicial. No campo da clonagem animal, diversos grupos de pesquisa apontaram a ocorrência de alterações epigenéticas como responsável pela baixa eficiência da técnica. O surgimento de tecnologias baseadas em MS, capazes de mapear de forma integral as MPTs nas histonas, abre caminho para a elucidação dos significados biológicos dessas alterações. Esse tipo de abordagem deve permitir correlacionar os fenótipos observados em embriões e em animais clonados com o padrão de suas marcações epigenéticas. Deve permitir também correlacionar o padrão epigenético das células doadoras de núcleo com os resultados da clonagem, bem como auxiliar na obtenção de protocolos que alterem o estado epigenético da célula doadora de núcleo antes da transferência nuclear e que favoreçam a reprogramação do núcleo somático pelo citoplasma do oócito. Conclusão Nos últimos anos, estudos envolvendo MS expandiram-se em ritmo impressionante no campo das ciências biológicas. Além dos princípios da técnica, foram citados neste trabalho exemplos do emprego da MS para análise de produtos lácteos e de resíduos de drogas utilizadas em produção animal. Uma área em expansão é também o desenvolvimento de novas aplicações em produção animal como exemplificado pelas novas contribuições da MS em Biotecnologia da Reprodução e pelas perspectivas de uso da MS em estudos sobre epigenética animal. Para isso, é fundamental desenvolver experiência científica em grupos multidisciplinares de modo a criar competências para novos desafios e resolver problemas na área de agronegócios. Referências bibliográficas AOKI, Y.; HAKAMATA, H.; IGARASHI, Y.; UCHIDA, K.; KOBAYASHI, H.; HIRAYAMA, N.; KOTANI, A.; KUSU, F. Simultaneous determination of azaperone and azaperol in animal tissues by HPLC with confirmation by electrospray ionization mass spectrometry. Journal of Chromatography B, Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, v. 877, n. 3, p. 166-172, 2009. Anais do II Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Produção Animal – 22 e 23 de junho de 2009 Embrapa Pecuária Sudeste – São Carlos – SP – Brasil 130 APPLIED BIOSYSTEMS (Org). 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