10. biologia molecular
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10. biologia molecular
10. BIOLOGIA MOLECULAR 10.1 Orientações gerais de coleta e transporte das amostras em relação ao exame solicitado EXAMES MATERIAL BIOLÓGICO ONDE COLHER Pesquisa qualitativa do vírus da Hepatite C (PCR) sangue (plasma) em tubo de coleta a vácuo com EDTA (5 ml) Teste de Quantificação de Carga Viral do HIV sangue (plasma) em tubo de coleta a vácuo com EDTA (5 ml) Teste de Quantificação de Carga Viral do HCV sangue (plasma) em tubo de coleta a vácuo com EDTA (5 ml) Genotipagem do HIV sangue (plasma) em 2 tubos de coleta a vácuo com EDTA (2 x 5 ml) Genotipagem do HCV sangue (plasma) em 2 tubos de coleta a vácuo com EDTA (2 x 5 ml) 10.2 Orientações específicas de coleta, processamento e transporte 10.2.1 HIV Quantitativo (Carga Viral) 10.2.1.1 Coleta da amostra a) Para os exames de Carga Viral não é necessário jejum ou qualquer preparo especial do paciente. Entretanto, deve-se evitar a coleta, após ingestão de alimentos gordurosos nas últimas 3 horas; b) A amostra clínica é o plasma; c) Coletar o 5 ml de sangue total em tubos vacuteiner com EDTA; d) Para a obtenção do plasma, centrifugar o sangue total a 3000 rpm durante 5 minutos. Não use plasma não centrifugado (separado após repouso espontâneo) ou hemolizado; não use plasma com vestígios de sangue; e) Volume de plasma necessário para o teste: 1 ml (exatamente); f) O tempo de viabilidade da amostra é aproximadamente de 2 horas após a coleta do sangue total, durante este período a amostra deve ser centrifugada o mais rápido possível para evitar que o plasma fique em contato com as células sanguíneas; 10.2.1.2 Preparo da amostra no Tampão de Lise a) O Tampão de Lise (Lysis Buffer) faz parte do conjunto de reagentes utilizados no processamento da amostra no teste de Carga Viral e é fornecido pelo LACEN; b) Após o procedimento de coleta, acima citado, a amostra deve ser processada e colocada no Tampão de Lise no prazo de viabilidade da mesma; c) Utilizando luvas novas e limpas; d) Retirar o Tampão de Lise da geladeira; e) Agitar e colocar em Banho-Maria a 37ºC por 30 minutos para dissolução completa dos cristais. Agitar por inversão várias vezes e verificar contra a luz até o desaparecimento dos cristais. Não use os tampões com cristais devido a perda funcional; f) Identificar os tubos com nome, data e hora da coleta; g) Centrifugar os Tampões por um minuto a 2500 rpm para a retirada do excesso de líquido na tampa; h) Pipetar 1 ml de plasma para o tubo de Tampão de Lise utilizando micropipetas automáticas com ponteiras com barreira, descartáveis, livres de RNAse e DNAse; i) Homogeneizar os tubos por inversão ou em agitador; 10.2.1.3 Conservação da Amostra e transporte a) A amostra em Tampão de Lise deve ser conservada em geladeira (2 a 8ºC) até o momento do processamento, por um período de até 5 dias; b) Após este período, deve ser mantido em freezer –80ºC por tempo indeterminado; c) O transporte deve ser realizado sob refrigeração, no prazo máximo de 5 dias. d) NUNCA manter a amostra em Tampão de Lise em freezer com temperatura de -20ºC. 10.2.2 HIV Genotipagem 10.2.2.1 Coleta da amostra a) Para os exames de Genotipagem não é necessário jejum ou qualquer preparo especial do paciente. Entretanto, deve-se evitar a coleta, após ingestão de alimentos gordurosos nas últimas 3 horas; b) A amostra clínica utilizada é o plasma; c) Coletar o sangue total em tubos a vácuo com EDTA – 2 amostras de 5ml de sangue total (total 10ml); d) Para a obtenção do plasma, centrifugar o sangue total a 1500 rpm durante 10 minutos. Não usar plasma não centrifugado (separado após repouso espontâneo) ou hemolizado; não usar plasma com vestígios de sangue. 10.2.2.2 Preparo da amostra, conservação e transporte a) Utilizar microtubos, estéreis, livres de RNAse e DNAse, de preferência com tampa de rosca, próprios para o congelamento; b) Identificar os tubos com o nome do paciente, data e hora da coleta; c) Utilizar luvas novas e limpas para manipular os tubos e a amostra; d) Transferir o plasma para os microtubos utilizando micropipetas automáticas com ponteiras com barreira, descartáveis, livres de RNAse e DNAse; e) Distribuir o total de plasma obtido em alíquotas de aproximadamente 1 ml por microtubo; f) Manter os microtubos armazenados a 4ºC até o momento de envio ao laboratório, mantidos a -20ºC no prazo máximo de 2 dias; g) Acondicionar individualmente os tubos em sacos plásticos transparentes e com boa vedação; h) Encaminhar as amostras para o LACEN/SC em caixa de isopor, contendo 4 unidades de gelo reciclável congelados; i) Após período de 2 dias a -20ºC, a amostra se não processada pode ser mantida no freezer –80ºC até o momento da reação por tempo indeterminado. 10.2.3 Testes Qualitativos, Quantitativos (Carga Viral) e Genotipagem do RNA do HCV 10.2.3.1 Coleta e preparo da amostra a) Não é necessário jejum ou qualquer preparo especial do paciente. Entretanto, deve-se evitar a coleta, após ingestão de alimentos gordurosos nas últimas 3 horas; b) Coletar 5 ml de sangue total, específico para os exames de biologia molecular, em tubo a vácuo com EDTA e gel separador. Centrifugar e encaminhar diretamente ao laboratório; c) Nos casos onde não for possível usar tubos com gel separador, colher em tubo a vácuo, com EDTA (não usar HEPARINA como anticoagulante); d) Para a obtenção do plasma, centrifugar o sangue total a 1500 rpm por 20 minutos. Não usar plasma não centrifugado (separado após repouso espontâneo) ou hemolizado; não usar plasma com vestígios de sangue; e) Identificar o tubo com nome, tipo do exame, origem e data da coleta; Nota: É importante que a amostra seja específica para os testes quantitativo, qualitativo e genotipagem do HCV para que não haja manuseio e conseqüentemente contaminação da amostra e o resultado seja confiável. 10.2.3. 2 Armazenamento da Amostra a) A amostras de plasma podem ser armazenadas em geladeira (2 a 8ºC) durante até 72 horas, ou congelada a –70ºC; Notas Importantes: Se não existir freezer –70ºC, o sangue não pode ser congelado a – 20ºC, devendo ser enviado ao LACEN, o mais rápido possível, dentro do período das 6 horas após a coleta. As amostras de plasma só podem ser submetidas a dois ciclos de congelamento e descongelamento, sem perda do RNA-HCV. 10.2.3.3 Transporte da amostra a) O sangue total deve ser transportado ao laboratório entre 2 e 25ºC, se houver tempo para ser processado até 6 horas após a coleta; b) O plasma deve ser transportado entre 2 e 8ºC. Notas: Nunca utilizar tubos de coleta reciclados; Nunca utilizar microtubos e ponteiras reciclados; As amostras de plasma que chegarem ao LACEN/SC com pacotes de gelo reciclável à temperatura ambiente serão descartadas como inadequadas. 10.2.4 Condições para Solicitação de Testes Bio-moleculares para Hepatite C CASO CONDIÇÕES Genotipagem Resultado do Teste PCR-Qualitativo Resultado da Biópsia ou Avaliação Médica Requisição: laudo médico para emissão de APAC (Ver item 10.2.4.1) PCR-Quantitativo (Indicação de tratamento) se Genótipo 1 Resultado da biópsia Requisição do laudo médico para emissão de APAC (Ver item 10.2.4.1) PCR-Quantitativo para monitorar tratamento Requisição de laudo médico para emissão de APAC (Ver item 10.2.4.1) PCR-Qualitativo para monitorar tratamento Requisição de laudo médico para emissão de APAC (Ver item 10.2.4.1) Diagnóstico (PCR-HCV Qualitativo) Número da notificação Resultado de Anti-HCV Requisição: laudo médico para emissão de APAC (Ver item 10.2.4.1) 10.2.4.1 Requições de APAC, específicas para Hepatite C Requisição de APAC para Genotipagem do HCV – pág. 89 Requisição de APAC para Teste Quantitativo do HCV – pág. 90 Requisição de APAC para Teste Qualitativo do HCV – pág. 91